בית ספר "תומר" דוגל בתפיסה כי המוזיקה והחינוך המוזיקלי, מעצבים את עולמו של התלמיד. המוזיקה מעשירה את עולמו התרבותי, התלמיד נחשף לסגנונות שונים, לתקופות שונות במוזיקה ולשפה עשירה.
לימודי המוזיקה כוללים: נגינה מעשית בכלי נגינה, לימוד תאוריה (שפת המוזיקה), תולדות המוזיקה ונגינה משותפת (תזמורת).
חשיפת הילדים לעולם המוסיקלי מגיל צעיר מעשירה את עולמם, מקדמת ומעצימה יכולות אישיות וחברתיות, מפתחת את התחום המוטורי, התנועתי, הרגשי, החברתי והערכי, ומקנה כישורי חיים, למידה ועמידה על במה.
השנה בית הספר נבחר אחד מתוך שישה בתי ספר בבאר שבע לבית ספר מוזיקלי כאשר כל שכבת גיל מתנסה בכליים מסוימים.
שכבה א'- כלי הקשה. ( דרבוקה, תיבת עץ, פעמונים, קליקלקים וכו..)
שכבה ב'- כלי קשת ( כינור, ויולה וצ'לו)
שכבה ג'- כלי קשת ( כינור, ויולה וצ'לו)
שכבה ד'- חליליות
שכבה ה'- חליליות
שכבה ו' – מטלופונים.
